質(zhì)粒小量抽提試劑盒(Plasmid Mini Preparation Kit, Plasmid Miniprep Kit)是一種用于從大腸桿菌中進行小量質(zhì)?？焖俪樘岬碾x心柱式試劑盒。
      本試劑盒適用于常用的EndA^-菌株DH5α、JM109和XL-1 blue等。對于EndA⁺菌株如JM110、BL21(DE3)、TG1和HB101等，可以順利完成質(zhì)粒抽提，但從EndA⁺菌株中抽提獲得的質(zhì)粒會有輕微的核酸酶污染，如果在內(nèi)切酶緩沖液中37℃孵育1小時會導致質(zhì)粒全部降解。從EndA⁺菌株中抽提質(zhì)粒時推薦使用的 質(zhì)粒小量抽提試劑盒(通用型)、質(zhì)粒中量抽提試劑盒(通用型)和 質(zhì)粒大量抽提試劑盒(通用型)。
      野生型大腸桿菌中表達Endonuclease I，質(zhì)粒小量抽提試劑盒能切割并降解雙鏈DNA。編碼Endonuclease I的基因是endA，如果endA突變失活，其基因型會被標注為endA1，相應(yīng)的突變菌株被稱為EndA^-菌株，而野生型菌株則被稱為EndA⁺菌株。常見的EndA^-和EndA⁺菌株參見附表1。從EndA⁺菌株中抽提的質(zhì)粒，微量核酸酶和質(zhì)粒結(jié)合而容易被共純化，導致容易降解。
      本試劑盒采用了一種新型的離子交換柱。在特定條件下，使質(zhì)粒能在離心過柱的瞬間，結(jié)合到質(zhì)粒純化柱上，在一定條件下又能將質(zhì)粒充分洗脫，從而實現(xiàn)質(zhì)粒的快速純化。無需酚氯仿抽提，無需酒精沉淀，12個樣品只需不足30分鐘即可完成。
      每個質(zhì)粒純化柱可以結(jié)合的質(zhì)粒量的上限約為20微克。每個純化柱可用于抽提1-5毫升用LB培養(yǎng)過夜的大腸桿菌。抽提所得質(zhì)粒的OD260和OD280比值一般在1.80左右。抽提獲得的質(zhì)粒量會受質(zhì)粒拷貝數(shù)等因素影響。抽提獲得的質(zhì)粒DNA的OD260和OD280比值也會因菌種不同等原因而略有波動。
      本試劑盒抽提所得到的質(zhì)?？芍苯佑糜谵D(zhuǎn)染細胞，DNA測序，PCR，基于PCR的突變，體外轉(zhuǎn)錄，轉(zhuǎn)化**，內(nèi)切酶消化等。
質(zhì)粒小量抽提試劑盒包裝清單：

保存條件：
      室溫保存，一年有效。
注意事項：
      **次使用前把試劑盒提供的RNase A全部加到溶液I (懸浮液)中，混勻，并在瓶上做好標記。加入RNase A后4℃存放。
      **次使用前在每瓶溶液IV (洗滌液)中加入54ml無水乙醇，混勻，并在瓶上做好標記。
      溫度較低時，溶液II和溶液III可能會有沉淀產(chǎn)生。使用前必須檢查一遍。如有沉淀，37℃水浴加熱溶解，混勻后使用。溶液II請勿過分劇烈混勻，否則會產(chǎn)生大量氣泡。
      溶液II使用完后，一定要蓋緊瓶蓋，防止被空氣中二氧化碳酸化。
      溶液II有強堿性，溶液II、溶液III和溶液IV對人體有刺激性，操作時請小心，并注意適當防護以避免直接接觸人體或吸入體內(nèi)。
      本試劑盒所有操作均在室溫進行，操作時無需冰浴。所有離心也均在室溫進行。
      廢液收集管在一次抽提中需多次使用，切勿中途丟棄。
      本產(chǎn)品**于專業(yè)人員的科學研究用，不得用于臨床診斷或**，不得用于食品或藥品，不得存放于普通住宅內(nèi)。
      為了您的**和健康，請穿實驗服并戴一次性手套操作。

質(zhì)粒小量抽提試劑盒使用說明：
1. 取過夜菌1.5毫升，5000g離心1分鐘收集**沉淀，棄上清。再重復一次，每管共收集3毫升過夜菌沉淀。
通常大腸桿菌宜用LB培養(yǎng)過夜(16小時左右)至OD值為2-4。建議5000g(通常為5000rpm左右)室溫離心1分鐘，如沉淀不充分則適當延長離心時間。時間過長或離心速度過快會使沉淀過于緊密，不利于加入溶液I后散開沉淀。直接倒掉上清，再倒入約1.5毫升菌液并重復上述操作，然后倒置于吸水紙上(可用普通草紙)，使液體流盡。如果**密度明顯偏低，可考慮使用更多菌液，再重復上述操作1-2次。對于高拷貝質(zhì)粒所用菌量一般不能超過5毫升，對于低拷貝質(zhì)粒所用菌量一般不能超過10毫升。過量的**會導致后續(xù)的裂解不充分。
2. 每管加入250微升溶液I，重懸**沉淀。確保沉淀完全散開，無可見**團塊。
確認溶液I中已經(jīng)添加了RNase A。*高速度vortex 5-10秒或更長時間，懸起沉淀。一定要充分混勻，對著光亮處觀察應(yīng)呈均勻的懸濁液，無明顯**團塊或絮塊。如果沒有vortex，可以用槍吹打沉淀使沉淀逐漸散開或用手指把沉淀彈開。
3. 每管加入250微升溶液II，輕輕顛倒離心管4-6次，使**完全裂解，溶液透明。
切勿vortex！vortex或其它劇烈操作會導致基因組DNA斷裂，易導致*終所得質(zhì)粒被基因組DNA污染。顛倒4-6次后，溶液應(yīng)變得透明，無團塊或絮狀物。如果加入溶液I后**沒有完全散開，那么顛倒4-6次后，可能還會有團塊或絮狀物。遇到有少量團塊或絮狀物產(chǎn)生的情況，可以增加顛倒次數(shù)3-5次，再室溫放置2-3分鐘，但總裂解時間不可超過5分鐘。
4. 每管加入350微升溶液III，隨即顛倒離心管4-6次混勻，可見白色絮狀物產(chǎn)生。
切勿vortex！顛倒次數(shù)也不宜過多，否則易導致*終所得質(zhì)粒的質(zhì)量下降。
5. *高速(13,000rpm左右)室溫離心10分鐘。
離心后會產(chǎn)生白色沉淀。離心時準備好下一步需使用的質(zhì)粒純化柱，廢液收集管，并在純化柱上做好標記。
6. 將上一步驟離心后的上清倒入或吸入到質(zhì)粒純化柱內(nèi)。*高速離心30-60秒，倒棄收集管內(nèi)液體。
質(zhì)粒倒入質(zhì)粒純化柱后，可以不用等待，直接離心。倒棄收集管內(nèi)的液體后，保留收集管繼續(xù)使用。
7. 在質(zhì)粒純化柱內(nèi)加入750微升溶液IV，*高速離心30-60秒，洗去雜質(zhì)，倒棄收集管內(nèi)液體。
加入溶液IV后可以不用等待，直接離心。倒棄收集管內(nèi)的液體后，保留收集管繼續(xù)使用。
8. 再*高速離心1分鐘，除去殘留液體并使痕量乙醇完全揮發(fā)。
注意：倒棄收集管內(nèi)液體后再離心，才能徹底去除微量的溶液IV。微量的溶液IV會影響質(zhì)粒的質(zhì)量。
9. 將質(zhì)粒純化柱置于潔凈1.5毫升離心管上，加入50微升溶液V至管內(nèi)柱面上，放置1分鐘。
溶液V需要直接加至管內(nèi)柱面中央，使液體被純化柱吸收。如果不慎將溶液V沾在管壁上，一定要震動離心管，使液體滑落到管底，以便被純化柱吸收。也可以用重蒸水或Milli-Q級純水替代溶液V，但是水的pH應(yīng)不小于6.5。溶液V加入后放置時間稍長，對于增加質(zhì)粒產(chǎn)量會略有幫助。如想得到較高濃度的質(zhì)粒，可以加入35微升溶液V洗脫。
10. *高速離心1分鐘，所得液體即為高純度質(zhì)粒。
質(zhì)粒小量抽提試劑盒通常所得質(zhì)粒濃度為0.1-0.3mg/ml左右。如果想得到高濃度的質(zhì)粒，可以采用常規(guī)的乙醇沉淀方法濃縮質(zhì)粒。
附表1. EndA^- and EndA⁺ strains of E. coli.

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