反轉(zhuǎn)錄PCR(Reverse transcriptase PCR,RT-PCR)是一種從RNA擴(kuò)增cDNA拷貝的方法。RT-PCR對(duì)于獲得與克隆mRNA的5’、3’末端序列和從非常少量的mRNA樣品構(gòu)建大容量的cDNA文庫(kù)方面都是極為靈敏與通用的方法。此外,RT-PCR還易于鑒定已轉(zhuǎn)錄序列是否發(fā)生突變及呈現(xiàn)多態(tài)性,還可用于測(cè)定基因表達(dá)的強(qiáng)度。我公司采用二步RT-PCR法,可滿足客戶不同的實(shí)驗(yàn)要求。
樣品要求:提供的樣品要新鮮并盡可能多,不推薦提供RNA樣品,或者提供cDNA,并盡可能詳細(xì)的提供背景資料(基因序列、Genebank accession number擴(kuò)增產(chǎn)物的用途等)。
基本步驟
1. 模板制備:見RNA提取技術(shù)服務(wù)。
2.引物設(shè)計(jì)
客戶提供上、下游引物,或者我公司提供的引物設(shè)計(jì)及合成(包括RT-PCR半定量檢測(cè)中的內(nèi)參引物)。
3. 反轉(zhuǎn)錄
(1)Microtube管中配制下列模板RNA/引物混合液,全量<15 μl。
試劑名稱 使用量
模板RNA 2μg
Oligo(dT)12-18 Primer(50μM) 2.5μl
(2)70℃保溫5分鐘后迅速在冰上急冷2分鐘以上。
(3)離心數(shù)秒鐘使模板RNA/引物的變性溶液聚集于Microtube管底部。
(4)在上述Microtube管中配制下列反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液。
試劑名稱 使用量
上述模板RNA/引物變性溶液
5×M-MLV Buffer 5μl
dNTP Mixture(各10 mM) 1.25μl
RNase Inhibitor(40 U/μl ) 25U
M-MLV(200 U/μl ) 200U
RNase free dH2O up to 25μl
42℃保溫1小時(shí)。
(5)70℃保溫15分鐘后冰上冷卻,得到cDNA溶液。
若需要表達(dá),參考基因表達(dá)服務(wù)。若需要進(jìn)行RT-PCR半定量分析,接著以下的操作。
4.RT-PCR半定量分析
PCR擴(kuò)增目的基因及看家基因,產(chǎn)物經(jīng)過(guò)瓊脂糖凝膠電泳后進(jìn)行灰度掃描分析。