巢式PCR通過獨特的兩輪擴增設計,在靈敏度上顯著優(yōu)于普通PCR,其核心優(yōu)勢體現(xiàn)在以下方面:

一、克服平臺期效應:
常規(guī)PCR在擴增到一定循環(huán)數(shù)后,由于底物耗盡或產(chǎn)物積累,擴增效率會下降,進入平臺期。而巢式PCR通過兩輪擴增,每輪都可以從頭開始,理論上可以進行更多的循環(huán),從而提高擴增倍數(shù),克服了單次擴增的平臺期限制。
二、極低模板檢測能力:
1、微量樣本適配性:可從10?基因組背景中檢測到1個拷貝的病毒基因,適用于病毒載量極低的早期感染(如HIV、HBV)或痕量DNA樣本(如法醫(yī)物證)。
2、模板濃度寬容度:對初始模板量要求遠低于普通PCR,當普通PCR因模板量不足無法擴增出條帶時,巢式PCR仍可有效檢出。
三、技術(shù)原理層面的靈敏度提升機制:
1、兩輪級聯(lián)擴增
l 第yi輪使用外部引物初步擴增目標序列,產(chǎn)物作為第er輪模板;
l 第er輪通過內(nèi)部引物對特異性片段二次放大,實現(xiàn)信號級聯(lián)增強。
2、引物設計優(yōu)化
內(nèi)部引物位于外部引物擴增產(chǎn)物內(nèi)部,進一步聚焦目標序列,減少背景干擾。
四、提高PCR的敏感性:
由于進行了兩次擴增,巢式PCR可以從低拷貝數(shù)的樣本中擴增出足量的產(chǎn)物,特別適用于檢測稀有或低豐度的DNA序列。
四、應用場景中的靈敏度優(yōu)勢:
1、?低豐度樣本檢測?
如結(jié)核分枝桿菌胃液檢測中,巢式PCR靈敏度顯著高于抗酸染色法(97.4% vs 50.64%)。
2、?復雜樣本分析?
在大黃魚弧菌病檢測中,三輪巢式PCR可檢出2.5 copies/μL的哈維氏弧菌。
五、注意事項:
1、?假陽性風險?:需嚴格分步操作,避免交叉污染。
2、?成本與時間?:靈敏度提升伴隨實驗步驟增加,需權(quán)衡效率與需求。?
巢式PCR的靈敏度優(yōu)勢使其成為微量核酸檢測的金標準技術(shù),尤其在jibing早期診斷、復雜樣本分析等場景中具有不可替代的價值。實際應用中需結(jié)合樣本特性與實驗條件,平衡靈敏度與操作可行性。