現(xiàn)代高效液相色譜中，分離效果好壞的一個重要指標是反相色譜填料的選擇。但是反相色譜填料的選擇范圍很寬，因此，要做合適的選擇，必須對此有一定的認識和了解。
一、硅膠基質填料
1、正相色譜正相色譜用的固定相通常為硅膠（Silica）以及其他具有極性官能團胺基團，如（NH2，APS）和氰基團（CN，CPS）的鍵合相填料。
由于硅膠表面的硅羥基（SiOH）或其他極性基團極性較強，因此，分離的次序是依據(jù)樣品中各組分的極性大小，即極性較弱的組份*先被沖洗出色譜柱。正相色譜使用的流動相極性相對比固定相低，如正已烷（Hexane），氯仿（Chloroform），二氯甲烷（Methylene Chloride）等。
2、反相色譜填料用的填料常是以硅膠為基質，表面鍵合有極性相對較弱官能團的鍵合相。反相色譜填料所使用的流動相極性較強，通常為水、緩沖液與甲醇、乙腈等的混合物。樣品流出色譜柱的順序是極性較強的組分*先被沖洗出，而極性弱的組分會在色譜柱上有更強的保留。
常用的反向填料有：C18（ODS）、C8（MOS）、C4（Butyl）、C6H5（Phenyl）等。
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