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蛋白質(zhì)組學(xué)iTRAQ基本策略
蛋白質(zhì)組(Proteome)的概念先由Marc Wilkins提出,指由一個(gè)基因組(genOME),或一個(gè)細(xì)胞、組織表達(dá)的所有蛋白質(zhì)(PROTein). 蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變. 在轉(zhuǎn)錄時(shí),一個(gè)基因可以多種mRNA形式剪接,并且,同一蛋白可能以許多形式進(jìn)行**后的修飾. 故一個(gè)蛋白質(zhì)組不是一個(gè)基因組的直接產(chǎn)物,蛋白質(zhì)組中蛋白質(zhì)的數(shù)目有時(shí)可以超過(guò)基因組的數(shù)目. 蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)處?kù)对缙凇鞍l(fā)育”狀態(tài),這個(gè)領(lǐng)域的專家否認(rèn)它是單純的方法學(xué),就像基因組學(xué)一樣,不是一個(gè)封閉的、概念化的穩(wěn)定的知識(shí)體系,而是一個(gè)領(lǐng)域. 蛋白質(zhì)組學(xué)集中於動(dòng)態(tài)描述基因調(diào)節(jié),對(duì)基因表達(dá)的蛋白質(zhì)水平進(jìn)行定量的測(cè)定,鑒定**、**對(duì)生命過(guò)程的影響,以及解釋基因表達(dá)調(diào)控的機(jī)制. 作為一門科學(xué),蛋白質(zhì)組研究并非從零開(kāi)始,它是已有20多年歷史的蛋白質(zhì)(多肽)譜和基因產(chǎn)物圖譜技術(shù)的一種延伸. 多肽圖譜依靠雙向電泳(Two-dimensional gel electrophoresis, 2-DE)和進(jìn)一步的圖象分析;而基因產(chǎn)物圖譜依靠多種分離后的分析,如質(zhì)譜技術(shù)、氨基酸組分分析等.
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