轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是什么?上?;鶢栴D告訴你
拿真核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序為例,實(shí)驗(yàn)流程分為總RNA提取-mRNA分離-建庫(kù)試劑-定量-文庫(kù)回收-橋式擴(kuò)增-上機(jī)測(cè)序;項(xiàng)目分析流程分為數(shù)據(jù)產(chǎn)出數(shù)據(jù)=數(shù)據(jù)去雜-轉(zhuǎn)錄組拼接-SSR分析和SNP分析-基因功能注釋-基因表達(dá)差異分析-差異基因表達(dá)模式聚類(lèi)-差異基因富集分析。
轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)大致指指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)全部轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合,包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA;狹義上指所有mRNA的集合。蛋白質(zhì)是行使細(xì)胞功能的主要承擔(dān)者,蛋白質(zhì)組是細(xì)胞功能和狀態(tài)的直接描述,轉(zhuǎn)錄組成為研究基因表達(dá)的主要手段,轉(zhuǎn)錄組是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的必然紐帶,轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是目前研究多的,也是生物體重要的調(diào)控方式。
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究對(duì)象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和,主要包括 mRNA和非編碼RNA 。轉(zhuǎn)錄組研究是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點(diǎn),通過(guò)新一代高通量測(cè)序,能夠快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的所有轉(zhuǎn)錄本序列信息,已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和**研發(fā)等領(lǐng)域。
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