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肽的溶解性及溶解方法
肽的溶解性
根據(jù)經(jīng)驗(yàn),溶解肽是一個(gè)很重要的環(huán)節(jié)。如果溶解不當(dāng)可能導(dǎo)致肽損失或者實(shí)驗(yàn)失敗。肽的溶解性主要取決于肽的序列,所以,如果實(shí)驗(yàn)允許,肽序列中至少應(yīng)包含20%的帶電殘基以增加其溶解度。
在使用之前,客戶(hù)可以遵循以下三個(gè)基本原則來(lái)選擇合適的溶劑溶解多肽。首先,所選溶劑一定能充分溶解多肽。其次,所選溶劑能與實(shí)驗(yàn)條件兼容,最后,所選溶劑不能與肽反應(yīng),也不能使肽降解。只要肽的量允許,可以先用少部分肽溶解,然后再將全部樣品溶解。如果需要從溶劑中回收肽,可以選擇一種初始溶劑使其在凍干后容易去除。
以下建議或許對(duì)您溶解肽有所幫助:
1. 少于5個(gè)氨基酸的肽一般溶于水溶液,強(qiáng)疏水的氨基酸(W,I,L,F(xiàn),M,V,Y)除外。
2. 如果帶電氨基酸平均分布于全部序列中,那么含有>25%帶電氨基酸(E,D,K,R,H)的親水肽和含有<25%疏水氨基酸的肽一般都能溶于水溶液。多肽的純化系統(tǒng)一般為0.1%TFA/水和0.1%TFA/CAN。因此,如果肽溶解在沒(méi)有緩沖能力或者緩沖能力很弱的緩沖液中,結(jié)果可能導(dǎo)致肽溶液呈酸性。在使用別的方法溶解肽時(shí)務(wù)必使溶劑的pH值近乎中性。酸性肽(E+D殘基數(shù)多于K+R+H殘基數(shù))和堿性肽(K+R+H殘基數(shù)多于E+D殘基數(shù))在中性pH值條件下比在酸性pH值下更易于溶解。
3. 疏水氨基酸含量為50%~75%的肽,即使序列中含有25%帶電氨基酸也有可能不溶于水或者部分溶解。最好先把肽溶于最少量的強(qiáng)溶劑(如:DMF,ACN,異丙醇,乙醇,乙酸,4-8M GdnHCl或尿素,DMSO(序列中沒(méi)有C,W,M時(shí)),及其它類(lèi)似的有機(jī)溶劑,最好將溶解肽的有機(jī)溶劑緩慢地逐滴加入水溶液中。如果溶液變渾濁,可能是達(dá)到了溶解極限,繼續(xù)溶解就沒(méi)什么用了。需要注意的是,最開(kāi)始選擇的溶劑應(yīng)該與實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)兼容。
4. 疏水氨基酸含量>75%的強(qiáng)疏水肽一般也不溶于水溶液。此類(lèi)肽也應(yīng)該先用強(qiáng)溶劑(如:TFA,甲酸)溶解,如果將其加入到水溶液中也可能產(chǎn)生沉淀。最后的肽溶液可能需要高濃度的有機(jī)溶劑使之變性,而有機(jī)溶劑一般不用于活細(xì)胞的生物功能研究。
5. S,T,E,D,K,R,H,N,Q,Y含量高(>75%)的多肽序列容易形成多余的分子間氫鍵網(wǎng)絡(luò),在濃的水溶液中容易形成凝膠。此類(lèi)肽可以用步驟3所述方法溶解。
為了減少溶解中可能出現(xiàn)的問(wèn)題,建議從設(shè)計(jì)上和序列上多考慮,以改善肽的溶解度。
肽的溶解方法
用哪種溶劑溶解合成肽一直是困擾多肽工作者的一個(gè)難題。根據(jù)不同的氨基酸序列,可以參考以下方法來(lái)溶解合成肽。最好是先將少量肽用水溶液溶解,不要一次將全部樣品都溶解掉。
1. 將酸性氨基酸Asp (D),Glu (E)和C端-COOH.的值定為-1。
2. 而將堿性氨基酸Arg (R),Lys (K),His (H)的值定為+1。
3. 計(jì)算肽中全部電荷量。
4. 如果肽的全部電荷為正值,則肽呈堿性,可以先用水溶解。如果肽不溶于水,可以用10%乙酸或者更高濃度的乙酸溶解。如果肽一點(diǎn)都不溶,加入TFA(<50 ul)助溶,并用去離子水稀釋至1ml。
5. 如果肽的全部電荷為負(fù)值,則肽呈酸性,可以先用水溶解。如果肽不溶于水,,加入NH4OH(<50 ul) 助溶,并用去離子水稀釋至1 ml。
6. 如果肽的全部電荷為0,則肽呈中性。中性肽需要用乙腈、甲醇、異丙醇等有機(jī)溶劑來(lái)溶解,也可以加入變性劑(如:尿素、鹽酸胍等)。
實(shí)例:
KRLMKSIEVIMPL: (+3) + (-2) = +1。此條肽呈堿性。見(jiàn)以上步驟4。
LVKMKSIEDPDCE: (+2) + (-5) = -3。此條肽呈酸性。見(jiàn)以上步驟5。
MVSRKDLVEHRDM: (+4) + (-4) = 0。此條肽呈中性。見(jiàn)以上步驟6。
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