凝膠成像分析系統(tǒng)用于對電泳凝膠圖像的分析研究，采用數(shù)字?jǐn)z像頭將置于暗箱內(nèi)的電泳凝膠在紫外光或白光照射下的影像取進計算機，通過相應(yīng)的凝膠分析軟件，可一次性完成DNA、RNA、蛋白凝膠、薄層層析板等圖像的分析，終可得到凝膠條帶的峰值、分子量或堿基對數(shù)、面積、高度、位置、體積或樣品總量。
樣品在電泳凝膠或者其他載體上的遷移率不一樣，以標(biāo)準(zhǔn)品或者其他的替代標(biāo)準(zhǔn)品相比較就會對未知樣品作一個定性分析。這個就是圖像分析系統(tǒng)定性的基礎(chǔ)。根據(jù)未知樣品在圖譜中的位置可以對其作定性分析，就可以確定它的成份和性質(zhì)。
樣品對投射或者反射光有部分的吸收，從而照相所得到的圖像上面的樣品條帶的光密度就會有差異。光密度于樣品的濃度或者質(zhì)量成線性關(guān)系。根據(jù)未知樣品的光密度，通過于已知濃度的樣品條帶的光密度指相比較就可以得到未知樣品的濃度或者質(zhì)量。這就是圖像分析系統(tǒng)定量的基礎(chǔ)。凝膠成像分析系統(tǒng)采用新技術(shù)的紫外透射光源和白光透射光源使光的分布更加均勻，大限度的消除了光密度不均造成的對結(jié)果的影響。
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