RT-PCR技術(shù)原理:提取組織或細(xì)胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機(jī)引物利用逆轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從而獲得目的基因或檢測(cè)基因表達(dá)。以下來了解合成cDNA引物的選擇:
1、 隨機(jī)六聚體引物:當(dāng)特定mRNA由于含有使反轉(zhuǎn)錄酶終止的序列而難于拷貝其全長(zhǎng)序列時(shí),可采用隨機(jī)六聚體引物這一不特異的引物來拷貝全長(zhǎng)mRNA。用此種方法時(shí),體系中所有RNA分子全部充當(dāng)了cDNA**鏈模板,PCR引物在擴(kuò)增過程中賦予所需要的特異性。通常用此引物合成的cDNA中96%來源于rRNA。
2、Oligo(dT):是一種對(duì)mRNA特異的方法。因絕大多數(shù)真核細(xì)胞mRNA具有3'端Poly(A+)尾,此引物與其配對(duì),僅mRNA可被轉(zhuǎn)錄。由于Poly(A+)RNA僅占總RNA的1-4%,故此種引物合成的cDNA比隨機(jī)六聚體作為引物和得到的cDNA在數(shù)量和復(fù)雜性方面均要小。
3、特異性引物:*特異的引發(fā)方法是用含目標(biāo)RNA的互補(bǔ)序列的寡核苷酸作為引物,若PCR反應(yīng)用二種特異性引物,**條鏈的合成可由與mRNA 3'端*靠近的配對(duì)引物起始。用此類引物僅產(chǎn)生所需要的cDNA,導(dǎo)致更為特異的PCR擴(kuò)增。