熒光定量PCR檢測的是起點熒光值,定量分析的是未經(jīng)PCR放大之前的起始模板量。
這就涉及到熒光定量PCR的第2個關(guān)鍵點——定量方式的選擇:相對定量和絕dui定量。
絕dui定量可測定目的基因在樣本中的具體拷貝數(shù),相對定量測定的是目的基因在兩個或多個樣本中的相對表達水平,定量方式的選擇取決于實驗?zāi)康摹?
標準品的要求:
(1)標準品與待測樣本用相同的引物進行擴增,確保引物在兩者中擴增效率相同。
(2)標準品來源可以是基因組DNA,質(zhì)粒DNA,純化的PCR產(chǎn)物,Total RNA(cDNA),體外轉(zhuǎn)錄的 RNA等,其中基因組DNA和Total RNA(cDNA)不能直接用作標準品。
(3)標準品必須經(jīng)過準確定量,其拷貝數(shù)必須已知。
(4)標準品與待測樣本要在同一次實驗以及相同的條件下完成,擴增效率盡量接近。
標準曲線的制作:
將標準品稀釋5~6個濃度梯度,稀釋倍數(shù)可以選擇5倍(cDNA)或10倍(質(zhì)粒DNA、體外轉(zhuǎn)錄RNA)。