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耐氨芐西林流感嗜血桿菌產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶機(jī)制研究
耐氨芐西林流感嗜血桿菌產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶機(jī)制研究
目的:探討耐氨芐西林的流感嗜血桿菌產(chǎn)生β
-
內(nèi)酰胺酶的機(jī)制。
方法
:對臨床分離的
112
株流感嗜血桿菌耐藥菌用紙片法作β
-
內(nèi)酰胺酶測定,用
PCR
法檢測產(chǎn)酶流感嗜血桿菌中的β
-
內(nèi)酰胺酶基因的存在。結(jié)果:紙片法測得產(chǎn)酶菌株
32
株,產(chǎn)酶率
28.6
%
(32/112)
;
32
株產(chǎn)酶菌中
PCR
法測β
-
內(nèi)酰胺酶基因陽性菌株
29
株,陽性率為
90.6%(29/32)
,其中質(zhì)粒
DNA
模板組陽性為
25
株,基因組
DNA
模板組陽性為
4
例。結(jié)論:
(1)
流感嗜血桿菌耐氨芐西林主要由質(zhì)粒介導(dǎo)產(chǎn)生β
-
內(nèi)酰胺酶所造成。
(2)PCR
法是
研究
流感嗜血桿菌是否攜帶β
-
內(nèi)酰胺酶基因及該基因所在位置的簡便而有效的
方法
。
自
1972
年**次發(fā)現(xiàn)流感嗜血桿菌因產(chǎn)β
-
內(nèi)酰胺酶而致耐氨芐西林以來[
1
],國外對耐氨芐西林流感嗜血桿菌的耐藥機(jī)制以及產(chǎn)β
-
內(nèi)酰胺酶的分子基礎(chǔ)
研究
,
呈逐年增加趨勢。
1978
年
Bryan
等[
2
]**報道了質(zhì)粒介導(dǎo)產(chǎn)生β
-
內(nèi)酰胺酶的流感嗜血桿菌。此后,圍繞流感嗜血桿菌中的質(zhì)粒編碼β
-
內(nèi)酰胺酶及其與耐氨芐西林的關(guān)系進(jìn)行了許多研究。我國由于流感嗜血桿菌的分離率較低,對此
問題
的研究一直沒有深入。本文作者在本實驗室成功提高流感嗜血桿菌分離率的基礎(chǔ)上[
3,4
],分離獲得
36
株耐氨芐西林的流感嗜血桿菌,用紙片法測定它們產(chǎn)β
-
內(nèi)酰胺酶的情況后,用
PCR
方法對產(chǎn)酶菌中β
-
內(nèi)酰胺酶基因的存在與否進(jìn)行了檢測,對耐氨芐西林的流感嗜血桿菌產(chǎn)生β
-
內(nèi)酰胺酶機(jī)制作了初步
分析
。
1
材料和方法
1.1
流感嗜血桿菌的分離培養(yǎng) 收集痰或咽拭子標(biāo)本,于
1 h
內(nèi)接種于改良的哥倫比亞巧克力瓊脂平板中,置
5% CO2
孵箱,
37
℃孵育
18
~
24 h,
對疑似流感嗜血桿菌的菌落分別于血瓊脂和營養(yǎng)瓊脂平板上作衛(wèi)星試驗,僅在血瓊脂平板上衛(wèi)星試驗陽性者為流感嗜血桿菌。用常規(guī)的紙片法(
K-B
法)對每個菌株作體外**敏感試驗,根據(jù)美國
NCCLS
標(biāo)準(zhǔn)判讀藥敏結(jié)果。從平板上挑取耐氨芐西林的單菌落接種于含
3 ml
液體
HTM
培養(yǎng)液的試管中,于
5% CO2
孵箱
37
℃孵育培養(yǎng)過夜,離心收集菌體用于質(zhì)粒制備等后續(xù)實驗。
1.2
紙片法測定β
-
內(nèi)酰胺酶 將流感嗜血桿菌培養(yǎng)物經(jīng)超聲裂解后直接涂布于β
-
內(nèi)酰胺酶紙片上,在
15 min
內(nèi)變紅者為陽性。
超聲儀為
Branson Sonifier 250
,β
-
內(nèi)酰胺酶紙片購自
Oxid
公司。
1.3
PCR
法檢測β
-
內(nèi)酰胺酶基因
1.3.1
PCR
引物 針對β
-
內(nèi)酰胺酶結(jié)構(gòu)基因的
PCR
引物由本校分子遺傳學(xué)開放實驗室用
PCGENE
軟件
PCRPLAN
程序設(shè)計,上海生工生物工程公司協(xié)助合成。引物序列為:上游引物:
5
′
TGGGTGCACGAGTGGGTTAC3
′,下游引物:
5
′
TTATCCGCCTCCATCCAGTC3
′。
1.3.2
PCR
反應(yīng)條件 用
PE2400
型
DNA
擴(kuò)增儀
,50
μ
l PCR
反應(yīng)體系中含有模板
DNA 1
μ
l
、上游下游引物各
1
μ
l
(濃度為
25
μ
mol/L
),
10
×緩沖液
5
μ
l
,
dNTP
混合物(
10 mmol/L
)
4
μ
l
,并用
ddH2O
補(bǔ)足至
50
μ
l
(
Mg2+
的終濃度為
1.5 mmol/L
),以
94
℃
3 min
→
(94
℃
1 min
→
55
℃
1 min
→
72
℃
1 min
,循環(huán)
30
次
)
→
72
℃
7 min
→
4
℃保溫。
PCR
反應(yīng)后取
10
μ
l
產(chǎn)物點樣,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳并拍照。
1.3.3
PCR
模板的制備 **質(zhì)粒
DNA
用常規(guī)堿裂解法分離、
RNase
Ⅰ消化、酚
/
氯仿抽提純化[
3
];**基因組
DNA
用菌體凍融法制備:取少量**于
1.5 ml
塑料離心管中,用蒸餾水重懸,加入少量溶菌酶于
37
℃水浴
5 min
,放入液氮迅速冰凍
5 min
,取出后立即放入
37
℃水箱融化
5 min
,重復(fù)凍融
3
次,室溫下
1
×
104 r/min
離心
5 min
,吸取上清液到新的離心管,加入
1.5
倍 體積的無水乙醇于
-20
℃沉淀
30 min
,
1.5
×
104 r/min
離心沉淀,用
10
μ
l TE
溶解后備用。
2
結(jié) 果
2.1
流感嗜血桿菌的分離 自
1997
年
10
月至
1998
年
11
月
,
從我院呼吸內(nèi)科及耳鼻咽喉科呼吸道感染患者中收集
634
份痰及咽拭子標(biāo)本,分離鑒定出
112
株流感嗜血桿菌
,
其中,藥敏試驗證明為氨芐西林耐藥的
36
株。
2.2
β
-
內(nèi)酰胺酶檢測結(jié)果
36
株耐氨芐西林流感嗜血桿菌中,紙片法測得產(chǎn)酶菌株
32
株,耐藥菌中產(chǎn)酶率
88.9%(32/36)
。
2.3
PCR
法檢測β
-
內(nèi)酰胺酶基因結(jié)果 用針對β
-
內(nèi)酰胺酶基因的上游和下游特異性引物擴(kuò)增后,陽性條帶大小為
486 bp
,擴(kuò)增結(jié)果與預(yù)期值相同。
32
株產(chǎn)酶菌中
PCR
陽性菌株
29
株,陽性率為
90.6%
。其中以質(zhì)粒為模板
PCR
陽性菌株
25
株,占產(chǎn)酶菌的
78.1%
(
25/32)
;對
7
株質(zhì)粒
DNA
模板
PCR
陰性的菌株,以基因組
DNA
為模板進(jìn)行
PCR
擴(kuò)增,結(jié)果有
4
株為陽性。
3
討 論
國外對耐氨芐西林流感嗜血桿菌產(chǎn)β
-
內(nèi)酰胺酶的分子機(jī)制研究,主要采用的方法是在大量培養(yǎng)**的基礎(chǔ)上,通過
CsCl
密度梯度超離心等方法獲取較大量的質(zhì)粒
DNA
,進(jìn)行限制性內(nèi)切酶酶切
分析
、瓊脂糖凝膠電泳、質(zhì)粒轉(zhuǎn)化試驗等,大致分析質(zhì)粒
DNA
的大小、結(jié)構(gòu),驗證質(zhì)粒介導(dǎo)的耐氨芐西林表型等,獲得質(zhì)粒介導(dǎo)的產(chǎn)酶及其與耐氨芐西林**的關(guān)系等的可靠證據(jù)[
6
]。但是,
自然
狀態(tài)的流感嗜血桿菌菌株中所攜帶的野生型質(zhì)粒的大小、結(jié)構(gòu)、拷貝數(shù)差異非常大,對**培養(yǎng)的數(shù)量、質(zhì)粒抽提純化的方法提出了很高的要求,其結(jié)構(gòu)的變異也造成電泳、酶切分析等方法難以做到**分析質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)。另外,野生型質(zhì)粒的分子量通常較大,常用的轉(zhuǎn)化實驗成功率不高;再加上野生型菌株中所含質(zhì)粒結(jié)構(gòu)復(fù)雜,而這些方法都未能直接鑒定質(zhì)粒
DNA
中是否攜帶有編碼β
-
內(nèi)酰胺酶的基因。
鑒于上述情況,本實驗設(shè)計了針對β
-
內(nèi)酰胺酶基因的特異性引物,對所分離獲得的產(chǎn)β
-
內(nèi)酰胺酶的耐氨芐西林流感嗜血桿菌中該酶編碼基因的存在情況進(jìn)行了直接的
PCR
檢測。結(jié)果發(fā)現(xiàn),
32
株產(chǎn)β
-
內(nèi)酰胺酶的流感嗜血桿菌,用可靠的堿變性法獲取的質(zhì)粒
DNA
為模板進(jìn)行
PCR
檢測,陽性率達(dá)到
78.1%
,而
7
株質(zhì)粒
DNA
模板
PCR
陰性的產(chǎn)酶菌株中,有
4
株在以染色體
DNA
樣品為模板進(jìn)行的
PCR
反應(yīng)中表現(xiàn)陽性。這些結(jié)果提示耐氨芐西林的流感嗜血桿菌編碼β
-
內(nèi)酰胺酶的基因主要存在于所攜帶的質(zhì)粒
DNA
上,而有少部分酶基因位于染色體
DNA
上,這與
文獻(xiàn)
報道的結(jié)論一致。從方法上看,本研究所采用的
PCR
法直接檢測耐氨芐西林流感嗜血桿菌中β
-
內(nèi)酰胺酶基因的方法,特異性高,標(biāo)本產(chǎn)β
-
內(nèi)酰胺酶的核苷酸序列具有高度的特異性;敏感性高,
PCR
方法可將待測
DNA
片斷的量擴(kuò)大百萬倍,可以檢測**含量極微的標(biāo)本;既可以測質(zhì)粒模板β
-
內(nèi)酰胺酶基因,也可以測染色體模板β
-
內(nèi)酰胺酶基因;如果配合
PCR
產(chǎn)物的序列測定等,還可用于β
-
內(nèi)酰胺酶分類、基因序列分析、分子流行病學(xué)調(diào)查等。但
PCR
方法有假陽性的情況,如β
-
內(nèi)酰胺酶基因結(jié)構(gòu)出現(xiàn)變異但未
影響
PCR
引物結(jié)合位點時,可能存在
PCR
陽性但基因并無活性的情況。從
理論
上講,能產(chǎn)生β
-
內(nèi)酰胺酶的菌株均應(yīng)有相應(yīng)的編碼基因存在,但本實驗中有
3
株
PCR
陰性,可能的原因是模板制備過程以及
PCR
反應(yīng)過程所造成的假陰性所致。雖然國外有用
PCR
方法檢測流感嗜血桿菌菌株、β
-
內(nèi)酰胺酶基因及其分類的報道[
7
],國內(nèi)袁藝等[
8
]曾用
PCR
法檢測流感嗜血桿菌菌株,但對產(chǎn)β
-
內(nèi)酰胺酶的耐氨芐西林流感???血桿菌,分別以其質(zhì)粒
DNA
和染色體
DNA
為模板,用
PCR
方法測β
-
內(nèi)酰胺酶基因,研究其產(chǎn)酶和耐藥機(jī)制的,國內(nèi)外均未見報道。
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